（友情提示：浅色模式观看效果最佳）
一般来说，小提琴图是一种绘制连续型数据的方法，可以认为是箱形图与核密度图的结合体。与箱形图相比，小提琴图显而易见的优势在于：除了显示与箱形图相同的统计数据外，它还显示了数据的整体分布。在此，交互式的小提琴图以其简单的操作带给我们更加直观的视觉体验，来体验一下它有什么功能吧。
功能介绍
基于plotly插件的可交互式的小提琴图绘制工具，适用于组别为2组及以上，组内有生物学重复的数据集，可展示多组数据的分布状态以及概率密度，在数据量较大时比箱线图更适用。
文件要求
01
特征丰度文件
例如alpha指数矩阵文件，第一列为样本名称，其余列为alpha多样性指数，至少一列指数（特征）数据。
图1 | 特征丰度文件格式示例
02
样本分组信息文件
第一列为样本名称，需要与上述特征丰度文件中的样本名称一致，第二列为分组名称，且表头名称必须为Sample及Group。
图2 | 样本分组信息文件格式示例
参数调整
01
主要参数
图3 | 主要参数
02
常用参数
图4 | 常用参数
作图步骤
01
上传文件
①请于主要参数中的特征丰度文件、样本分组信息文件处上传您所要进行分析的文件，如果此处未上传文件，您将无法得出结果。上传成功后，将会于“选择文件”后显示您上传的文件名；
此处为上传成功示例：
图5 | 文件上传成功示例
02
调整其他参数
①图片标题：默认为Violin Plot，可接受默认或自行输入；
②X轴标签角度：默认为45，可接受默认或点击调整；
③横轴刻度字体大小、纵轴刻度字体大小、纵轴标题字体大小：可接受默认或自行输入；
④字体类型：默认"Arial"，可在下拉菜单进行其他选择；
⑤展示数据点：选择是否在图中展示数据点，当数据量较大时可选择关闭。默认为“展示”，可在下拉菜单进行其他选择；
⑥数据点大小：展示数据点的大小。默认为“7”，可接受默认或自行输入；
⑦box配色方案：平台共提供26种配色方案，包括多种期刊配色供您挑选。默认为“配色方案1”，可在下拉菜单进行其他选择；
⑧注释：用于结果的自定义标记，即历史记录中的注释处，可接受默认或自行输入。
03
最终提交
文件上传成功后请点击“提交”，右侧工作区将提示您所需时间。
如图所示区域：
图6 | 工具预估耗时提示处
结果分析
01
结果展示
（图片为使用示例文件及其他参数保持默认时的结果）
分析结果图将会在此处展示，点击“进入交互式作图”可进入交互式界面进行个性化设置。
点击“恢复默认设置”将会清除所有个性化设置，此处的示例图将会自动恢复系统默认设置的状态。
图7 | 结果展示处
02
交互式作图
图8 | 交互式界面
图9 | 交互式界面可定制内容
图10 | 交互式界面可定制内容
图11 | 图片全局风格调整项gif
图12 | 图例配置gif
图13 | 标题设置gif
图14 | X轴配置gif
图15 | Y轴配置gif
图16 | 样本点调整gif
03
结果说明
5.3.1、小提琴图
①小提琴图中横坐标为分组，纵坐标为指数（特征）数据；
②不同颜色的小提琴表示不同的分组；
③小提琴图中心白色矩形的上底边和下底边代表该组特征值的上四分位数和下四分位数，中间横线表示该组特征值的中位数；
④从小提琴图中心白色矩形上底边和下底边延伸出去的两条线段，其端点代表最大值和最小值（注意是非离群点的最大最小值）；
⑤小提琴图中的黑点为数据点；
⑥外部形状即为核密度估计，宽度即为频率。较宽的部分代表观测值取值的概率较高，较窄的部分则对应于较低的概率。
图17 | 小提琴图
历史记录
点击欧易集团云平台界面右上角的“登录”，您可以进行免费注册，用您注册的账号登录欧易云平台个人中心，在此之后使用云平台所有的小工具将会存有记录。您可以点击下图中的“历史记录”查看使用小提琴图交互小工具的使用记录，或点击右上角“个人中心”查看所有小工具任务记录。
图18 | 历史记录示例
请问对输入文件的格式有什么要求呢？
您好，首先感谢您的咨询。我们的小工具支持txt、xls、xlsx这几种文件格式。
请问绘制小提琴图对样本数量有什么要求呢？
您好，首先感谢您的咨询。小提琴图适用于组别为2组及以上的数据集。
交互式作图可以带您更全面地了解各个层次的细节，定制您最称心的个性化图片。以上就是小提琴图交互小工具的介绍，欧易云平台正在开发更多的交互式小工具，期待您的试用反馈。
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END
排版人：小久
原创声明：本文由欧易生物(OEBIOTECH)学术团队报道，本文著作权归文章作者所有。欢迎个人转发及分享，未经作者的允许禁止转载。
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