【第一篇|软件安装】甲基化芯片分析工具SeSAMe教程

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对于芯片数据的下游分析，甲基化芯片的用户群为DNA甲基化数据分析技术的发展做出了重大贡献，生物信息学界已经开发了许多开创性的计算工具，如ChAMP、Minfi、RnBeads和wateRmelon等。在本系列的教程中，我们将以R软件框架下的SeSAMe软件和小鼠甲基化芯片数据为例，向您介绍如何利用SeSAMe软件对小鼠甲基化芯片以及其他甲基化芯片的数据进行分析。希望您喜欢这个视频教程，我们也希望能有机会为您未来的表观基因组学发现提供更多工具。

操作脚本

GitHub安装：

https://github.com/zhou-lab/sesame-tutorials/blob/main/1.%20Installation.R

BioConductor软件链接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/sesame.html

install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("sesame")

BiocManager::install("sesameData")

sesameDataCache()

library(sesame)

sesame_checkVersion()