舒桐科技长期致力于基因编辑领域,其中也包括对脱靶检测手段的大力研发。SITE-Pro是由鼓润公司基于SITE-seq体外脱靶检测手段自主研发的高效、高敏感、高特异性、高通量的sgRNA脱靶检测及筛选的方法。
SITE-seq原理如下:提取高分子量DNA,直接进行体外切割,加带有生物素标记的接头,DNA片段化,加上另外一端接头,PCR扩增完成文库构建。最后采用PE150策略进行测序。
设计多条sgRNA后,利用SITE-Pro筛选切割效果最高,或者脱靶最低的sgRNA;无需再进行传统的耗时耗力的低通量筛选验证;
无论是植物还是动物,还是无法获取大量DNA或者高分子量DNA(如石蜡切片/长期冻存的细胞),都可采取该方法进行脱靶检测。另外,相较于体内脱靶检测,覆盖的脱靶位点更为全面。这对于基因治疗极为重要;
不仅适用于SpCas9,还适用于SaCas9,AsCpf1和LbCpf1等
舒桐生物科技利用SITE-Pro对文献常检测的位点HEK293细胞系的site 1进行了脱靶检测,找到了更多的脱靶位点。
服务项目 | 内容 | 周期 | 交付形式 |
---|---|---|---|
10条sgRNA以上 | 建库+测序+分析 | 25-35个工作日 | sgRNA质粒(可选)+原始数据+可视化结题报告 |