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面议
SITE-seq体外脱靶检测及高通量sgRNA筛选
产品属性
品牌
舒桐生物
产地
广州
型号
SITE-seq体外脱靶检测及高通量sgRNA筛选
关注度
0
信息完整度
关闭
产地:广州; 品牌:舒桐生物
珠海舒桐医疗科技有限公司
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产品描述
TE-Pro
体外脱靶检测
舒桐生物科技长期致力于基因编辑领域,其中也包括对脱靶检测手段的大力研发。近年来,我们成功开发了
GUIDE-pro
体内脱靶检测及
SITE-pro
体外脱靶检测。
SITE-pro
是由鼓润公司基于
SITE-seq
体外脱靶检测手段自主研发的高效、高敏感、高特异性、高通量的
sgRNA
脱靶检测及筛选的方法。
SITE-seq
原理如下:提取高分子量
DNA
,直接进行体外切割,加带有生物素标记的接头,
DNA
片段化,加上另外一端接头,
PCR
扩增完成文库构建。最后采用
PE150
策略进行测序。
相关链接:
舒桐生物科技有限公司 (generulor.com)
SITE-seq
原理及实验流程
舒桐
SITE-Pro
优势
无需高分子量
DNA
,普通提取的
DNA
即可;
DNA
需要量少,传统的
SITE-seq
每个样本至少需要的
DNA
为
10ug
,改造后的
SITE-Pro
仅需
5ug
就能完成实验;
不受物种限制,无论是植物还是动物都可进行检测;
可同时检测多条
sgRNA
的在靶机脱靶,可用于大规模的
sgRNA
筛选;
不仅能检测
SpCas9
的脱靶,还能检测
SaCas9
,
AsCpf1
和
LbCpf1
的脱靶;
脱靶位点相较于细胞内脱靶检测,其覆盖更加全面;
服务周期短,从准备
DNA
到最终可视化结果呈现,仅需
1
月。
舒桐升级版
SITE-Pro
的应用场景
高通量
sgRNA
筛选:
设计多条
sgRNA
后,利用
SITE-Pro
筛选切割效果最高,或者脱靶最低的
sgRNA
;无需再进行传统的耗时耗力的低通量筛选验证;
脱靶检测:
无论是植物还是动物,还是无法获取大量
DNA
或者高分子量
DNA
(如石蜡切片
/
长期冻存的细胞),都可采取该方法进行脱靶检测。另外,相较于体内脱靶检测,覆盖的脱靶位点更为全面。这对于基因治疗极为重要;
不仅适用于
SpCas9
,还适用于
SaCas9
,
AsCpf1
和
LbCpf1
等
实验示例
杭州舒桐生物科技有限公司利用
SITE-Pro
对文献常检测的位点
HEK293
细胞系的
site 1
进行了脱靶检测,找到了更多的脱靶位点。
服务内容
服务项目
内容
周期
价格
交付形式
SITE-Pro
建库+测序+分析
25-35
个工作日
12000
元
sgRNA
质粒(可选)+原始数据+可视化结题报告
样品要求
DNA
样品总量:
10ug
以上,浓度
50ng/ul
以上;
DNA
样品纯度:
OD260/280=1.8~2.0
;
DNA
样品完整性:
DNA
无降解,需提供凝胶电泳检测胶图。
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