2.3 数据分析方法
使用 Proteome Discoverer 1.3 软件对原始谱图进行数据库搜索，具体参数如下，流程图如图 2 所示：
数据库：融合蛋白对应的氨基酸序列；
一级质量偏差：20 ppm；二级质量偏差：0.02 Da；三级质量偏差：0.8 Da；
酶：trypsin+Chymotryspin；
酶漏切位点：2；
图 2. Proteome Discoverer 1.3 软件对 ETD-triggered CID 原始数据进行二硫键定位分析的流程示意图
3. 结果与讨论
3.1 以肽段 P1：SKQEGCRL-肽段P2：CRPGF为例：
a. 色谱质谱提取流图如下所示：
由上图可以看出，该肽段对应的一级母离子在 13.96 min 洗脱出来，相应的质量偏差在 5.4 ppm。
b. ETD 二级碎裂匹配图
由上图可以看到，二硫键连接的两条肽段在经过 ETD 碎裂后，不仅产生了相应的两条肽段的碎片离子，而且也同时产生了二硫键连接在一起的其它碎片离子信息。
c. CID 三级碎裂匹配图
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