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分子克隆-蛋白表达实验指南(三)

2020.7.27
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

若有非特异性条带,可进行Touchdown PCR,提高引物的特异性。
     PCR反应条件:
            1      94C     5min
            2      94C     45s
            3      65C     45s      退火温度视不同引物而定,此处65C仅作例证
            4      72C     1min     go to step 2; 30 cycle
            5      72C     7min
            6      4C      x min   该步视情况而定,若PCR过夜则x=12h
      step4的1min视基因长度而定,Taq DNA polymerase合成效率为2kb/min。
  
  Taq PCR摸索好退火温度和延伸时间等后进行Pfu PCR。Pfu DNA合成效率比Taq酶(2000bp/min)低,因此Pfu
  PCR的延伸时间比Taq PCR适当延长20s。
  电泳验证后进行Pfu PCR
  System(30µl):
                10*reaction buffer(for Pfu enzyme)     3µl
                    dNTP                            1.2µl
                primers   As                      0.6µl
                         Sp                      0.6µl
                    cDNA                           0.5µl
                ddH2O                          23.3µl
                    Pfu                              0.3
      做四个30µl体系,以便进行胶回收。
  关于PCR更多的问题可以参照附件中有关PCR的综述。
  
  6.  胶回收(使用前检查kit里的Washing buffer是否已加无水乙醇,预开55-65度水浴)
  采用上海申能博彩生物技术有限公司的DNA凝胶回收试剂盒,操作步骤如下:
  A 紫外灯下切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶,计算凝胶重量。
  B 每100mg胶加400ul的SN solution,于55-65C加热,间断混合,直至凝胶块完全熔化(约6-8min)。
  C 每400ul的SN solution加入100ul的solutionB,混匀。
  D 把混合液加入3S柱(DNA收集柱),室温放置2分钟后,10000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的液体。
  E 向3S柱中加入600ul Wash solution, 10000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的液体。
  F 重复e step
  G 10000rpm离心2分钟,尽量取出液体,倒掉收集管中的液体。
  H 将3S柱置于干净的1.5ml的EP管中,在3S柱的膜中央加入30ul预热的TE solution,
  55-65。C水浴放置2分钟(可在水浴锅中加盖放置,提高洗脱效率),15000rpm离心1分钟。-20。C保存。为了提高洗脱的效率,可先用20ul洗脱,然后再重复用10-20ulTE洗脱。洗脱步骤相同。
  胶回收时尽量用较少的TE洗脱(15ul),提高胶回收产物的浓度。或DNA电泳时上样量增加也可获得相同效果。
  PS:胶回收产物与载体连接时,决定连接效率的主要是胶回收产物的浓度。载体的含量可相对降低

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