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干货—以qPCR方法为例谈谈细胞治疗数据分析方法验证 (上篇)

德国耶拿生命科学部
2021.11.05
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       细胞治疗与基因治疗行业目前正在蓬勃发展,每个新药走上临床都需要经过IND申报,在进行IND申报则必须要对产品质量控制的检测方法进行开发和验证,不论是委托第三方检测,还是独立完成,都需要根据2020药典标准完成以下几个项目的验证:专属性、准确度、精密度(包括重复性、中间精密度和重现性)、检测限、定量限、线性、范围和耐用性。由于分析方法具有各自的特点,并随分析对象而变化,因此需要视具体情况拟订验证的指标。

       我们以qPCR方法为例,来聊一聊如何设计实验获得数据完成这些验证项目。

       1、专属性Specificity

       专属性是指在其他成分(如杂质、降解产物、辅料等)可能存在下,采用的分析方法能正确测定出被测物的能力。如方法专属性不强,应采用多种不同原理的方法予以补充。

       鉴别反应、杂质检査和含量测定方法,均应考察其专属性。

       对于qPCR方法来说,需要设置阴性对照,阳性对照,空白对照,在阴性对照和空白对照无Ct值,阳性对照有效扩增的情况下,方才认定专属性成立;

        2、准确度Accuracy

       准确度是指用该方法测定的结果与真实值或参考值接近的程度,一般用回收率(%)表示。测定回收率R(recovery)的具体方法可采用“回收试验法”和“加样回收试验法”。

      根据准确度数据要求,有两种方案。

      第一种在线性范围内,取同一浓度(相当于100%浓度水平)的供试品,用至少6份样品的测定结果计算回收率进行评价。

      第二种方案在线性范围内,设计高中低3种不同浓度,每种浓度分别制备3份供试品进行测定,用至少9份样品的测定结果进行评价。

      两种方法的选定应考虑分析的目的和样品的浓度范围。对于有关物质检查的准确度,还需对定量限水平的准确度进行评价。

      对于qPCR方法来说,准确度的要求一般为回收率50~150%;这一验证项目里,可能出现挑战的在于低浓度样本,因此需要一个灵敏度高,数据重复性好的仪器来进行实验。

       3、精密度Precision(包括重复性Repeatability、中间精密度Intermediateprecision和重现性Reproducibility)

       重复性是指在相同条件下,由同一个分析人员测定所得结果的精密度。

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如上图所示,左边的图精密度良好,但是准确度不符合要求;右边的图平均值的准确度符合要求,但是精密度较差) 

      重复性数据要求:在规定范围内,取至少6份同一浓度(分析方法拟定的样品测定浓度,相当于100%浓度水平)的供试品,即实测样品,进行评价;或根据线性范围,设计3种不同浓度,每种浓度分别制备3份供试品进行测定,用至少9份样品的测定结果进行评价。

      注意,对于qPCR方法来说,这6份样品或9份样品需要在同一次实验进行。

      中间精密度是指在同一个实验室,不同时间由不同分析人员用不同设备测定结果之间的精密度。中间精密度是考察随机变动因素对精密度的影响,注意控制变量,每次只能验证一个项目。

      重现性是指在不同实验室由不同分析人员测定结果之间的精密度。在分析方法从研发实验室转到QC实验室的过程中,通常会进行重现性的考察。

      含量测定和杂质的定量测定都需要考察方法的精密度。

     精密度数据要求:对于qPCR方法,需要提供相对标准偏差RSD,计算公式如下,样品中待测定成分含量和精密度RSD可接受范围请参考ChP2021版中9101中可接受范围表。

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      使用qPCR方法进行绝对定量时,要求RSD≤30%,这一要求不仅针对最终定量数据,对于仪器本身提供的Ct值的RSD也需要控制,仪器会提供一个SD值作为Ct值的精密度参考,一般以0.25为限。

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       德国耶拿定量 PCR 仪在外源性宿主 DNA 残留检测方面有很多的实际应用案例,客户的使用体验反馈有:

l  仪器检测灵敏度高

 实验数据的重复性好

l  运行速度快

 中文软件很好用

l  仪器运行很安静


      分析方法验证介绍未完待续……


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