视频实操SCI作图课(8)：一秒看懂数据集逻辑关系—高级韦恩图

迈维代谢

2022.4.17

作者迈维代谢

TA的动态

随着技术的不断进步，代谢组学、微生物组学、基因组学、转录组学和蛋白质组学等大量的测序数据不断产生，数据关系也越来越复杂。理解不同数据集之间的关系对于数据分析至关重要，使用合适的可视化方法对于阐明已建立的关系尤为重要，说明这些关系的最简单和最有效的方法之一就是生成维恩图，维恩图可以使研究人员能够快速观察实验组和对照组以及群体之间的信息，从而探索数据集之间的关系。

视频解说教程

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什么是韦恩图？

韦恩图是一种多元素逻辑联系工具，可以用于展示各样本或各分组之间共有或特有元素的数量，韦恩图一般分为2元韦恩图、3元韦恩图、4元韦恩图和5元韦恩图。

绘制韦恩图需要什么样的数据？

代谢组学，微生物组、转录组和蛋白组的数据都可以用来绘制韦恩图，以代谢组数据为例，表头是A/B/C/D/E，分别代表5个样本，每一列下面的数据是代谢物的名称，将表格另存为TXT文本格式，在云平台找到高级韦恩图小工具，上传数据点击“提交“就可以绘制出韦恩图，真正实现一键式绘图。如果要换成其他组学数据，将代谢物的名称换成其他组学名称即可，如OUT名称、基因名称或者蛋白质名称等。

韦恩图怎么看？

以2元韦恩图为例，下面是A和B两个样本的韦恩图，A样本用橙色圆圈，B样本用绿色圆圈，两个圆圈的重叠部分用AB两个颜色叠加展示，图中有3个数值，AB两个样本中的数值分别代表这两个样本中特有的代谢物个数，分别是90个和77个，中间重叠部分的数值代表两个样本中共有的代谢物个数，是27个。这样两个样本之间的逻辑关系就理清楚了，如果需要获得样本间共有或者特有代谢物进一步分析，下载韦恩图分析结果数据就可以快速获取。

同样的道理，4元韦恩图，用了4种不同颜色的圈分别代表4个样本，正中间重叠的部分就是4个样本共有的代谢物个数，从这个图里我们可以看到4个样本共有的代谢物个数是0，A/B/C/D四个样本各自独有的代谢物分别从对应颜色中获取，数量分别是63/71/50/87个，通过这个图还可以挖掘其中任意2个样本或者任意3个样本共有的代谢物个数，例如：A和B两个样本共有的代谢物个数是AB两个圈的重叠区数值，是26+1+0+0=27个，A/B/C三个样本共有的代谢物个数是ABC三个圈的重叠区，是1+0=1个。

智能小帮手

高级韦恩图不仅可以进行韦恩图颜色搭配，字体大小等个性化选择，还会根据输入的数据类型绘制不同展示图，韦恩图最多只能展示5组数据，但是在实际研究中超过5个组的情况是经常存在的，在迈维云平台高级韦恩图小工具中，输入超过5组数据会自动绘制UpsetR图，该图也可以反映各个样本之间的逻辑关系，对超过5个样本的数据，UpsetR图展现出的各样本逻辑关系更清晰。

UpsetR图大致可以分成三个部分，第一个部分是绿色虚线圈出来的部分，这里展示的是各样本里面含有代谢物个数的条形图，第二部分是紫色虚线圈出来的部分，这里展示的是样本独有或几个样本共有代谢物的数目，第三部分是蓝色虚线圈出来的部分，这部分展现出来的是各样本之间的交叠矩阵，纵向查看，一个黑点说明上方条形图展示的是某一个样本独有的代谢物个数，两个黑点（或多个点），说明上方数值是两个（或多个）样本共有的代谢物个数。

迈维代谢云平台高级韦恩图小工具可以帮助您快速分析各样本（或分组）之间的逻辑关系。