液质联用仪分类有多种。
1、按分析目的可分：实验室液质联用仪和工业液质联用仪。
2、按离子化方式可分：快原子轰击电离液质联用仪、基质辅助激光解吸电离液质联用仪、电喷雾电离液质联用仪和大气压化学电离液质联用仪等。
3、按质量分析器的工作状态可分：静态液质联用仪和动态液质联用仪。
4、按分析对象的状态可分：原子液质联用仪和分子液质联用仪。
5、按用途可分：生物液质联用仪、制药液质联用仪、化工液质联用仪、食品液质联用仪、医用液质联用仪、氨基酸液质联用仪、核酸液质联用仪、RNA液质联用仪、DNA液质联用仪、细胞液质联用仪、菌体液质联用仪、抗生素液质联用仪和维生素液质联用仪等。
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