用小鼠、大鼠,鼠和狗对伊曲康唑的急性毒性和慢性毒性进行了研究，结果显示伊曲康唑的耐受性良好。
在妊娠的大鼠和小鼠中使用大剂量的伊曲康唑（分别为40mg/日和80mg/kg日，或更高）时，发现伊曲康唑会增加动物胎仔异常的发生率，并对动物胚胎产生不良影响。
在九项致突变试验中，伊曲康唑未显示致突变性。
在致癌性研究中，对小鼠给药剂量升至最高80mg/kg时，未显示至癌性，对雄性大鼠剂量升至20mg/kg和对雌性大鼠剂量升至40mg/kg时，未显示致癌性，对雌性大鼠剂量达40mg/kg时，软组织肉瘤的发生率轻微增加，这可能人是由于结缔组织的非肿瘤性、慢性炎症反应增加而致。这些纤维黄样变化被认为与脂类和胆固醇代谢的系统性紊乱有关。此紊乱在大鼠长期毒性研究中的高毒性剂量中也有出现，这也可能与血清胆固醇水平升高有关。
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