内含子归巢蛋白的作用是什么？

　　这种蛋白的作用是什么呢？ω内含子的产物是一种核酸内切酶，它能识别ω-基因并将它作为靶切开其双链。这种核酸内切酶识别18bp的靶序列，此含有内含子插入位点。靶序列的剪切是在每条链插入位点的3’端这一侧2个碱基处交错切，这样剪切位点占4个bp，产生了凸出的单链末端。

　　这种类型的剪切是和转座子移到新位点的机制有关。双链的断裂的起始了基因的转变，在转变中ω+基因序列产生了一个新拷贝取代ω-基因，这个过程涉及通过复制机制进行转座，且仅在DNA水平上发生或以DNA取决代的方式，或以模板转换的方式（与重组修复相类似）来完成。要注意内含子的插入中断了内切酶对这个序列的识别，这样使其稳定。

　　其它含有开放读框的第I类内含子也可以移动。内含子永久存在的机制是相同的：内含子编码的核酸内切酶剪切内含子将要插入的特殊靶位点。插入的细节是有不同的。例如T4噬菌体td内含子所编码的核酸内切酶就是在靶位点上游24bp处剪切，然后内含子本身插入这个位点，而不是其新产生的拷贝。

　　虽然内含子移动的机制是共同的，但靶位点的序列和内含子编码区域之间并无同源性。据推测内含子有一个共同的进化区域，但很明显它们有很大的歧化。靶位点是在各种靶序列中最长的，对于核酸内切酶来说也是最特异的。结果内含子永久性地插入到单个的靶位点中，而且不插入基因组的任何其他地方，此就称为内含子归巢( intron homing)。

　　含有编码核酸内切酶序列的内含子在不同细菌和低等真核生物中都有所发现。由此产生一种游离的因子，其编码的功能涉及到RNA的剪接或者DNA分子之间的移动。与此相关的观点认为内含子编码区域中密码子的用法与外显子稍有不同。