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探针的非放射性标记技术-2

2020.9.14
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

一;仪器:同上

二:试剂:ECL标记盒,其余同上

三:操作:1:将待标记的DNA稀释至10ng/ml

2:将上述DNA在100℃5分钟,冰浴5分钟

3:离心后加入10ulECL标记混合物,混合均匀

4:加10ul戊二醛溶液混匀,37℃20分钟,此反应液可直接用于杂交也可在50%甘油中-20℃保存。


4:PCR扩增制备带标记探针

用标记脱氧单核苷酸部分代替PCR反应体系中的脱氧核苷酸(一般是带标记的dUTP代替dTTP),经PCR扩增后标记基团随机搀入扩增产物-DNA探针中。这样使探针浓度高,可检测标记基团量多,灵敏度高,与缺口平移法制备探针相比,具有方便简捷的特点,并且由于具高灵敏度因此在检测低丰度,低拷贝数的目的片断时,尤其有效。一般可用来进行搀入的带标记基团可以为同位素标记基团、臭化脱氧尿苷标记基团、也可为其他非放标记基团如生物素、地高辛等。下面以生物素和地高辛为例介绍探针的PCR标记技术。

一:生物素标记

应用bio-11-dUTP部分替代dTTP搀入PCR扩增探针中

操作1:配制反应体系

dNTP的组成dATP、dCTP、dGTP各20mmol,dTTP 15mmol, bio-11-dUTP 5mmol混匀,其他试剂如常规PCR。

2:25循环后,冻存,取出化冻,趁下层水相尚在冰冻状态,吸尽石蜡油

3:水相中20mg/ml糖原1ul, pH5.2 2.5MnaAC10ul,220ul无水乙醇。混匀后-20℃过夜

4:离心取沉淀,冷冻干燥后100ul水或TE复溶。

二:地高辛标记

应用dig-11-dUTP部分替代dTTP搀入PCR扩增探针中

操作1:配制反应体系

dNTP的组成dATP、dCTP、dGTP各200umol,dTTP 130umol, bio-11-dUTP 70umol混匀,其他试剂如常规PCR。

2:35循环扩增产物

3:扩增产物纯化与DIG随机标记探针方法相同(仅沉淀时,50ulPCR反应液中加入5ul4MliCl和150ul冰乙醇)。

注:1:标记时标记基团在dNTP中占的比例不能太高,因标记基团与dTTP相比具位阻效应,比例太高PCR扩增及以后的杂交都要受到影响。

2:靶DNA用量不能太高,生物素标记中控制在0.2fmol左右;地高辛标记中可低至0.1ng。


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