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异硫氰酸胍/氯化铯超速离心法制备 RNA 实验

2020.8.11
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

实验材料 细胞和组织

试剂、试剂盒 氯仿氯化铯溶液二硫苏糖醇EDTA乙醇异硫氰酸胍裂解缓冲液异丙醇N-月桂酰肌氨酸氯化锂液氮β-巯基乙醇苯酚

仪器、耗材 离心机和转子研钵和杵超速离心管

实验步骤

一、材料


1. 缓冲液、溶液和试剂


氯仿


氯化铯溶液,5.7mol/L(5.7mol/L 氯化铯,25 mmol/L 醋酸钠,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)


用焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水


二硫苏糖醇(DTT),0.2 mmol/L


EDTA,1mmol/L,pH8.0


乙醇,70%(体积分数)


异硫氰酸胍裂解缓冲液 (4mol/L 异硫氰酸胍,25 mmol/L 醋酸钠,pH6.0,1mmol/LEDTA,pH8.0)


异丙醇


N-月桂酰肌氨酸,20%(200 g/L)


氯化锂(LiCl),8mol/L


液氮


β-巯基乙醇,10 ml/L


苯酚, 水饱和,pH4.0


2. 离心机和转子


BeckmanTi50 转子或相当的转子


3. 特殊设备


研钵和杵,用 DEPC 处理过的水洗涤,预冷


超速离心管(异质同晶共聚材料),或相当的 Polygon, 或相当的高速匀浆器


4. 细胞和组织


细胞/组织,冻于液氮


二、方法


1. 使用研钵和杵在液氮下将样品研磨成细粉。使用 Polygon 均化器或其他合适的器具在 7 ml 胍裂解缓冲液中均质化组织或细胞(达 1X109 个)。


2. 将 4 ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液加到超速离心管中。


3. 将 1ml5.7mol/L 的 CsCl 溶液、120ul10mol/L 的沒-巯基乙醇和 240ulN-月桂酰肌氨酸加到裂解产物中。


4. 将氯化铯/裂解产物混合物混合,小心使之位于离心管中的氯化铯溶液上分层。


5.20°C 下 180000 g 离心 21 h。


6. 移弃氯化铯上清液,小心避免扰动管底的 RNA 沉降物。


7. 小心将 RNA 沉降物再溶解于 750ul 异硫氰酸胍裂解缓冲液中。


8. 加等体积酚,混匀。


9.10000g 离心 15 min。


10. 将水相转移到一新管中。重复水相的酚抽提,直到界面变清。


11. 向清澈的水相加 1 倍体积氯仿。


12. 混合,l0000 g 离心 l0 min。


13. 将水相转移到一干净试管中。加等体积的异丙酵和 1/10 体积 8mol/L 的氯化锂。10000g 离心10min。


14. 移弃上清液。用 750ul70% 乙醇洗涤 RNA 沉降物,10000 g 离心。


15. 移弃乙酵,风干沉降物,再溶解于 50~500ul0.2 mmol/L 的 DTT 中。


16.RNA 储存于-70°C。


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