分析测试百科网

搜索

喜欢作者

微信支付微信支付
×

Real-time PCR实验注意事项(防RNA酶污染和常用RNA酶抑制...-2

2020.9.01
头像

王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

[注意] 1、整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。

另外,提取上清这步一定要小心,靠近沉淀的部分一定要舍得不要,要不然会有蛋白质污染,影响比值

2、加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周,-20℃保存一年。

总mRNA的提取(自己的经验)

一、关于Trizol Reagent需要的试剂

1. Chloroform:氯仿 (分析纯)

2. Isoproplyl alcohol:异丙醇(分析纯)

3. 75% Ethanol(in DEPC-treated water):75%乙醇。要求用分析纯无水乙醇并用0.01%的DEPC处理过的无Rnase的水稀释。

4. RNase-free water:无Rnase的水。方法是:将DEPC按0.01%(V/V)加在d H2O中500ml(50μl),在37℃过夜,并高压灭菌即得(150℃ 3小时)

5. 一次性塑料手套

6. 注意:DEPC有致癌之嫌

二、关于Trizol Reagent的使用过程:

1. Homogenization(匀浆)

a.Tissues:组织

每100mg组织匀浆加1mlTrizol试剂,样品体积不能超过Trizol试剂的10%。

b.Cells Grown in monolayer(单层细胞接毒后出现病变的)

针对JEV细胞总RNA的抽提法:

BHK21细胞长成单层后,接毒0.5-1ml(采用大瓶),37℃吸附1h,倒掉,加维持液(含2%的血清和HEPE8的MEM)约5ml,维持天。出 现75%-100%的病变时,以PBS(预冷)冲洗细胞两次,直接在细胞瓶中加入Trizol试剂1ml/10cm2,吹吸几次,以裂解细胞(细胞瓶有两 种常用规格:大的约45cm2,小的约30cm2,故所用Trizol试剂分别约为4.5ml和3ml。Trizol试剂的加入是依细胞瓶而定,以盖满瓶 底为度,而不是依据细胞的数量,否则可导致DNA的污染)具体方法如下:(样品一定要新鲜)

(1)组织接入预冷的EP管中,加入Trizol试剂1ml/10cm2(量一定要加足,否则易污染),混匀,吹吸几次,以破裂细胞,置室温5min,以使核蛋白复合物彻底分离。



(2)加氯仿0.2ml(每1ml Trizol试剂加入氯仿0.2ml),盖好,剧烈震荡15s,置室温2-3分钟。

(3)4℃离心,10000g×15min,离心后,混合物将分离为底层为浅红的、中层为酚-氯仿相、上层为无色的水相。RNA包含在水相中,水相的体积约相当于所加的Trizol试剂量的60%。

(4)仔细吸取上层水相,移至另一EP管中。

(5)加0.5ml异丙醇,以沉淀RNA(每1ml Trizol试剂加入0.5ml异丙醇),置室温10min。

(6)4℃离心,10000g×10min。RNA沉淀为一层如凝胶样透明的小块附在管底和管壁。

(7)弃上清液,加入预冷的75%乙醇1ml(每1ml Trizol试剂加入75%乙醇至少1ml),震荡,充分洗涤沉淀,4℃离心,5500g×5min。弃上清液,空气干燥(或真空干燥)后,沉淀重悬于无 Rnase dH2O中,吹吸几次,55℃-60℃作用10分钟以溶解RNA,-70℃保存备用。

(8)抽提出的细胞总RNA干燥后加水50μl,取10μl加无Rnase水990μl,稀释100倍成1ml。于0.5cm厚的石英比色杯中,以无Rnase水为对照,在721型紫外分光光度计下检测,结果应为:A260/280 ratio<1.6。

(9)分离组织10mg(纯组织)加800μl Trizol试剂。

(10)扩增产物的鉴定


互联网
文章推荐